MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 chromosome

Total Repeats: 1595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007205	CTTT	2	8	31	38	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007205	TTTA	2	8	66	73	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007205	T	6	6	205	210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007205	TCA	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007205	T	6	6	320	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007205	GTA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007205	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007205	TGT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007205	CAC	2	6	10323	10328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_007205	CCA	2	6	10331	10336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007205	TTCG	2	8	10389	10396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007205	TGC	2	6	10451	10456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007205	AT	3	6	10918	10923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007205	TA	3	6	10944	10949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007205	AAT	2	6	21392	21397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007205	ACA	2	6	21416	21421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007205	T	7	7	36823	36829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007205	T	6	6	38797	38802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007205	AT	3	6	38829	38834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007205	TTAA	2	8	39025	39032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007205	TGA	2	6	39141	39146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007205	CAA	2	6	39173	39178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007205	TAT	2	6	39330	39335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007205	TAA	2	6	39374	39379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007205	TTA	2	6	39416	39421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007205	TA	3	6	40235	40240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007205	TA	3	6	40244	40249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007205	AAT	2	6	41665	41670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007205	TGG	2	6	41674	41679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007205	ATTAT	2	10	41767	41776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007205	TGG	2	6	41817	41822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007205	TGGT	2	8	41826	41833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007205	CTA	2	6	41871	41876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007205	ATT	2	6	43710	43715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007205	TA	3	6	43745	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007205	T	6	6	43777	43782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007205	T	6	6	46031	46036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007205	TTC	2	6	46057	46062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007205	T	7	7	46076	46082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007205	ATA	2	6	52845	52850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007205	T	6	6	52865	52870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007205	TA	3	6	53039	53044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007205	ATTTA	2	10	53047	53056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007205	TCA	2	6	53138	53143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007205	AT	3	6	53153	53158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007205	TAA	2	6	53165	53170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007205	A	6	6	58004	58009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007205	A	9	9	59938	59946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007205	TAA	2	6	59980	59985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007205	A	7	7	60055	60061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007205	ATC	2	6	62239	62244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007205	ATTT	2	8	62250	62257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007205	ATTA	2	8	62285	62292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007205	TAA	3	9	62301	62309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007205	ATTTT	2	10	64562	64571	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007205	AAT	2	6	65023	65028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007205	TA	3	6	65030	65035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007205	GGT	2	6	65381	65386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007205	TTA	2	6	66343	66348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007205	TTA	4	12	66350	66361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007205	TAT	2	6	66366	66371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007205	ATT	2	6	66373	66378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007205	GAT	2	6	66379	66384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007205	TTA	2	6	66399	66404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007205	ATA	2	6	66411	66416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007205	TAAA	2	8	66480	66487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007205	TAAA	2	8	75779	75786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007205	TAA	2	6	75828	75833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007205	TAA	2	6	75881	75886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007205	TTA	2	6	75919	75924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007205	A	7	7	75934	75940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007205	T	7	7	75955	75961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007205	ATA	2	6	75966	75971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007205	T	7	7	76030	76036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007205	A	6	6	76045	76050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007205	T	6	6	76066	76071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007205	AAC	2	6	76077	76082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007205	T	6	6	76092	76097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007205	GA	3	6	76102	76107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007205	T	8	8	76111	76118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007205	GA	3	6	76123	76128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007205	ATTT	2	8	76132	76139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007205	T	7	7	76149	76155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007205	T	8	8	76158	76165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007205	ATT	2	6	76173	76178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007205	AT	3	6	76182	76187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007205	T	9	9	76187	76195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007205	T	8	8	76221	76228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007205	AT	3	6	76247	76252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007205	TTTTA	2	10	76253	76262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007205	AT	3	6	76279	76284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007205	T	6	6	76284	76289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007205	ATT	2	6	76302	76307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007205	A	12	12	76317	76328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007205	T	8	8	76332	76339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007205	A	14	14	76372	76385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007205	ATA	2	6	76414	76419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007205	T	6	6	76423	76428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007205	A	6	6	76429	76434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007205	TATT	2	8	76494	76501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007205	ATT	2	6	76512	76517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007205	A	6	6	76535	76540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007205	T	6	6	76557	76562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007205	TAATTT	2	12	76598	76609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007205	AAT	2	6	76627	76632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007205	T	6	6	76638	76643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007205	TG	3	6	76648	76653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007205	ATA	2	6	76716	76721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007205	TA	4	8	76720	76727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007205	TTG	2	6	76750	76755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007205	ATT	2	6	76756	76761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007205	TAT	2	6	76795	76800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007205	GA	3	6	76867	76872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007205	GA	3	6	76926	76931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007205	ATTT	2	8	76969	76976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007205	ATT	2	6	77008	77013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007205	TTA	2	6	77038	77043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007205	TAAA	2	8	77089	77096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007205	ATG	2	6	78495	78500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007205	TCC	2	6	78537	78542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007205	AAATT	2	10	78544	78553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007205	ATT	2	6	79360	79365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007205	T	6	6	79364	79369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007205	T	6	6	80114	80119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007205	ATT	3	9	80130	80138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007205	CAT	2	6	80140	80145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007205	AT	3	6	80149	80154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007205	T	7	7	80183	80189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007205	A	8	8	80204	80211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007205	TTG	2	6	80227	80232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007205	TG	3	6	80270	80275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007205	TA	3	6	80279	80284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007205	GTT	2	6	80297	80302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007205	CTT	2	6	80308	80313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007205	TAA	2	6	84932	84937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007205	TAA	2	6	85015	85020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007205	TAA	2	6	85028	85033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007205	AAT	2	6	85038	85043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007205	ATA	2	6	85048	85053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007205	ATA	2	6	85591	85596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007205	TAA	2	6	86381	86386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007205	ATT	2	6	86423	86428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007205	ACC	2	6	87302	87307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007205	T	8	8	87356	87363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007205	TACA	2	8	89745	89752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_007205	T	6	6	89801	89806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007205	TAA	2	6	89861	89866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007205	TA	3	6	91500	91505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007205	AAT	2	6	101816	101821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007205	T	6	6	104556	104561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007205	CTTT	2	8	106417	106424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_007205	A	6	6	106508	106513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007205	A	7	7	106551	106557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_007205	T	8	8	113077	113084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_007205	A	7	7	129451	129457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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